기본통칙은 세무상 제 처리기준을 통일하고 그 내용을 명확히 하기 위하여 현재 통용되고 있는 세무회계처리에 관한 관습을 기초로 회계이론과 상법 등 타법률 관계를 고려하여 실무회계 중에 정착되어 있는 개별 예규 및 통첩과 세무관서의 내부적인 취급규정 중에서 기본적이고 공통적인 사항을 체계화한 것을 말한다. 2002. 4.15.자로 조세특례제한법기본통칙이 전면개정 되었기에 본고에서는 개정 통칙의 주요내용을 사례중심으로 설명하였다. 주요 내용은 다음과 같다. 합병법인의 피합병법인이 신고조정으로 손금산입한 조세특례제한법상의 준비금을 승계하는 경우 피합병법인에게 익금산입하지 아니한다. 그리고 2개 이상의 업종을 영위하는 법인의 중소기업 규모판정시 사업전체의 종업원의 자본금 또는 매출액을 기준으로 판정한다. 한편, 최초로 연구, 인력개발이 세액공제대상이 되거나 제외되는 경우 직전 4년간 발생액은 당해 연도와 같은 기준에 의하여 계산하며, 임시투자세액공제를 받는 기간 외의 기간의 투자에 대하여는 다른 투자세액공제를 받을 수 있다. 본고는 개정내용과 관련한 사례와 해설 및 명세서도 제공하였으니 참고하기 바란다. 

<목차>
1. 연구·인력개발비의 연평균발생액의 계산
  (1) 적용대상법인
  (2) 공제세액의 계산
2. 투자세액공제의 선택
3. 지급이자 손금불산입대상 타법인주식의 범위
  (1) 개요
  (2) 손금불산입대상에서 제외되는 타법인 주식